Il primo intervento consiste nell’allargamento incorporando il corridoio coperto sul lato nord fronte strada e ricavando oltre all’altare maggiore i primi due altari laterali; contemporaneamente venne edificato il protiro con le due eleganti colonnette su una delle quali è incisa la data 1519, più tardi trasferito nell’attuale posizione con un successivo intervento terminato nel 1688. La consacrazione, sotto la

protezione di San Bernardo da Mentone avvenne il 26 agosto 1546 ad opera del vescovo Vittore Soranzo, collaboratore del card. Pietro Bembo, vescovo di Bergamo. I verbali della visita di S. Carlo Borromeo, avvenuta in data 4 ottobre 1575, parla della presenza di tre altari: il maggiore con immagine e statue di Santi in una cappella a volta e dipinta, l’altare del Santissimo e quello di S. Maria. Altra sostanziale modifica ebbe inizio nel 1673 e termina nel 1688: prolungato il corpo centrale fino alla lunghezza attuale, demolito il soffitto a travi di linea gotica ed elevata la volta a botte in muratura, ricavate all’inizio della navata due cappelle laterali per l’altare del S.Rosario e di S.Antonio mentre nella seconda arcata ricavata in quella di sinistra la porta laterale e in quella di destra in un primo tempo il pulpito e solo più tardi l’altare dell’Addolorata. Negli anni 1696-97 è ricavato dietro l’altare il coro fantoniano con le belle cariatidi. Numerose le opere d’arte: dalla maestosa ancona opera della scuola fantoniana con la pala centrale raffigurante il patrono S. Bernardo da Mentone e i compatroni S. Bernardo dottore e S. Maria Maddalena,  all’altare maggiore tutto in legno dorato di bottega fantoniana, al portale maggiore in marmo nero sagomato e a quello laterale in pietra arenaria lavorata. La tavola della Madonna con il Bambino e i Santi Giovanni Battista e Francesco d’Assisi, posta al centro dell’Altare del Rosario, rappresenta il pezzo artistico più pregiato, la pala dell’altare di S.Antonio o dei morti raffigura appunto S.Antonio ed è uno dei quadri più antichi mentre sulla volta della Chiesa sono dipinti episodi biblici dell’Antico Testamento. Da notare anche i due portali in marmo rosso sagomato di accesso alla sacrestia, da una parte, e alla vecchia sacrestia dall'altra e l’organo che risale al 1809, opera della ditta Perolini di Villa d’Ogna. Infine diversi sono gli arredi artistici: il pezzo più prezioso è la croce astile in lastra d’argento, già citata all’inizio, una croce astile in lamina dorata e diversi calici tra cui uno che porta la data 1510 e proviene dalla Chiesa del Dosso.